一時停止を無視して大怪我をしてしまいました。このように私の過失が高そうな場合でも補償は受けられるのでしょうか。

例えば、直進車対直進車で一時停止を無視してしまった場合の一般的な過失割合は20:80となり、一時停止を無視した側に大きく過失がかかります。
そのような場合、相手に対しては損害の20％を請求することが可能です。
つまり、相手に過失が少しでもあればあなたの過失が大きくとも補償を受けることは可能です。
ただし、あなたに過失が大きいことで相手から「補償はしません」と言われてしまう可能性もあります。
「ついうっかり」ということは日常ではよくあるお話ですが、それが高い代償に繋がらないとは限りません。
一時停止はしっかりしましょう。