加害者から、５０万円を渡され、これで終わりにして欲しいと言われました。受け取っても良いのでしょうか。

一般的には、望ましくないと思います。５０万円という金額が適切なものであるかは不明ですし、最悪の場合、受け取った後に重大な後遺障害が生じることもあるためです。まずは、その金額が妥当なのか等を専門家に相談すべきでしょう。